旋风除尘器的最大优点是：除尘效率高,达85%左右。但是它的阻力大(70~80毫米水柱)，磨损快，消耗钢材多(净化烟气每1000米/时约耗80~120公斤钢材)，因此在使用上受到一定的限制。
旋风除尘器一般都处于负压运行，因此在灰斗及放灰管路中，如果有任何不严密之处，就会造成漏风，破坏除尘器的正常运行，降低效率。放灰门的漏风，可采用封闭严密，动作灵活的双级翻板锁气器。双级串联锁气器的上下两只锁气器，不要同时动作，当上层锁气器排灰时，下层锁气器关闭，间隔一定时间后，下层锁气器再排灰，此时上层锁气器要处在闭合状态。这样交叉落灰，可以避免漏风。为达到这个目的，可以把重锤往外靠，使锁气器间断排灰，同时将中间贮灰室做得大一些。
旋风除尘器一般都有几个旋风子组合在一起，同用一个贮灰斗。运行中，灰斗的灰量不断增加，如果不按时放灰，会使飞灰积满灰斗，影响旋风子的正常工作，降低除尘效率，甚至使旋风子严重堵塞，失去除尘作用。
大型工业锅炉采用的C型除尘器，都是由若干个旋风子组合在一起，旋风子与进出口烟道连接方式是否合理，直接影响到烟气分配的均匀程度和除尘器的阻力等方面。目前各厂连接方式有两种:一种是进出口烟道与旋风子进出口成90°布置，称为垂直连接;另一种是成45°斜角布置，进口烟道的面积，随烟气量的减少而相应的变小，称为阶梯形连接。垂直布置的主要缺点是，烟气分配不均，烟气流中的灰粒受惯性力影响,将会集中在后面几只旋风子，因此磨损一般也比前面的严重得多。阶梯形连接的优点是，烟气分配均匀,阻力小,目前已被广泛采用